La Junta Directiva es el órgano ejecutivo responsable de administrar, coordinar y ejecutar las actividades, servicios, programas y proyectos de la Federación y actualmente está integrada por un Presidente, un Secretario, un Tesorero y dos Vocales. Dichos cargos son cubiertos por personas con hemofilia o por familiares de las mismas, que destacan de manera significativa por su interés, convicción y participación en el cumplimiento de los fines y objetivos de la Federación.
Para el periodo 2019 – 2021 la junta directiva está conformada por los siguientes miembros:
